Вы знакомы уже с историей аниме Эльфийская песнь... Игра развивается по аниме, действия манги не учитываются.
Как же так? Королева Диклониус, она же Люси, убита! Но кто же тогда оказывается в лапах военных? Не всё так просто, как казалось бы.
Убит был другой диклониус, очень похожий на Люси (она же ей и притворялась именно в тот момент). Сама же Люси была на воле, далеко от города. Но позже и саму её схватили, заперев в лаборатории. Та долго сидеть взаперти не собиралась. Правда, в лаборатории пришлось попотеть, военные не на шутку стреляли, поэтому Люси было довольно сложно устраивать побег. Что бы отвлечь их, она освободила всех диклониусов, совершив побег.
Многие освобождённые диклониусы теперь на свободе. Помимо этого, у диклониусов появилась новая способность, которая ещё не была известна людям. Но диклониусы уже начали её осваивать. Во-первых, диклониусы могли общаться на большом расстояние мысленно, одна из полезных способностей. Но во-вторых, у каждого диклониуса появилась своя новая сила...
Началась война между диклониусом и человеком. Что же будет с человечеством?